En 1989, Hank Pym se rend au Triskelion pour rencontrer Howard Stark, Peggy Carter et Mitchell Carson pour annoncer sa démission du S.H.I.E.L.D. après avoir découvert que l’organisation a tenté de répliquer sa propre technologie rapetissante d’Ant-Man, que Pym qualifie d’extrêmement dangereuse et qu’il devraient la détruire.
Dans le présent, la fille séparée de Pym, Hope van Dyne et son protégé, Darren Cross, l’ont contraint de quitter la direction de sa propre entreprise, Pym Technologies. Pym est encore plus dévasté lorsque Cross révèle son projet : une combinaison avancée de rapetissement, nommé le Yellowjacket, basé sur le costume original de Pym.
Dans le même temps, plusieurs mois après les événements dramatiques en Sokovie, le voleur bien-attentionné, Scott Lang, est libéré de la prison d’état de San Quentin après y avoir passé trois ans pour avoir volé son ancien patron. Il retrouve un ancien camarade de cellule, Luis, et ses deux partenaires Kurt et Dave. Ils lui proposent un nouveau cambriolage, cependant Lang affirme vouloir arrêter de faire cela. Il apprend que son ex-femme s’est mariée avec un officier de police, Jim Paxton. Elle lui révèle aussi qu’elle ne peut plus lui laisser voir sa fille tant qu’il n’aidera pas à subvenir aux besoins de l’enfant.
Désespéré, Lang accepte le cambriolage par inadvertance que lui offre Luis après avoir été viré un petit travail à cause de son casier judiciaire. Lang s’introduit secrètement dans la maison. Il entre par effraction, défonce le coffre et trouve quelque chose qui s’apparente à une vieille combinaison. Il la ramène à l’appartement après s’être échappé. Il essaye de comprendre ce qu’est la combinaison et l’enfile. En appuyant un bouton, il rapetisse accidentellement à la taille d’un insecte et tente de retrouver sa taille initiale. Terrifié par cette expérience énigmatique et troublante, il tente de retourner dans la maison pour remettre le costume à sa place, mais il est arrêté par la police. Pym, le propriétaire de la maison dans laquelle s’est introduit Lang, se fait passer pour un avocat et donne le costume à Lang pour qu’il s’échapper de prison. Malgré sa confusion, Lang revêt à nouveau le costume et s’échapper de la prison avec l’aide d’un groupe de fourmis.
Lang découvre que Pym l'a manipulé grâce à Luis pour lui faire voler le costume en tant que test. Il souhaite que Lang devienne le nouveau Ant-Man et vole le costume de Yellowjacket à Cross, que Pym considère comme un équipement extrêmement dangereux, littéralement capable de destruction massive. Pym a demandé à Van Dyne d'espionner Cross, ce qu'elle a fait, bien qu'elle en veuille à son père pour leur relation tendue, pour ne pas lui avoir dit la vérité à propos de la mort de sa mère et pour ne pas lui avoir laisser arrêter Cross. Dans le même temps, Lang est entraîné par Van Dyne et Pym pour perfectionner son contrôle et sa manipulation du costume d'Ant-Man qui donne en plus de cela une force surhumaine. Lang apprend aussi à contrôler les fourmis.
Pour la suivre de leur plan contre Cross, Pym envoie Lang pour une mission très risquée où il doit voler un dispositif au Complexe des Avengers, un des anciens entrepôts de Howard Stark. Cette mission s'achève finalement par un combat entre Lang et le Faucon, mais Lang parvient à s'échapper et à voler le dispositif.
Plus tard, Pym, frustré, dit à Hope la vérité sur la mort de sa mère, Janet van Dyne. Sa mère était l'acolyte de Pym, sous son identité super-héros Ant-Man, la Guêpe, et s'est sacrifiée pour empêcher une tête nucléaire russe d'être activée. Elle a disparue du Royaume Quantique. Il admets qu'il ne veut pas que la même chose arrive avec Hope. Les deux finissent donc par se reconcilier.
À venir...